Développement d'un système de détection des infections associées aux soins à partir de l'analyse de comptes-rendus d'hospitalisation
Caroline Hagège, Denys Proux, Quentin Gicquel, Stéfan Darmoni, Suzanne Pereira, Frédérique Segond, Marie-Helène Metzger
Résumé : Cet article décrit la première version et les résultats de l'évaluation d'un système de détection des épisodes d'infections associées aux soins. Cette détection est basée sur l'analyse automatique de comptes-rendus d'hospitalisation provenant de différents hôpitaux et différents services. Ces comptes-rendus sont sous forme de texte libre. Le système de détection a été développé à partir d'un analyseur linguistique que nous avons adapté au domaine médical et extrait à partir des documents des indices pouvant conduire à une suspicion d'infection. Un traitement de la négation et un traitement temporel des textes sont effectués permettant de restreindre et de raffiner l'extraction d'indices. Nous décrivons dans cet article le système que nous avons développé et donnons les résultats d'une évaluation préliminaire.
Abstract : This paper describes the first version and the results obtained by a system which detects occurrences of healthcare-associated infections. The system automatically analyzes hospital discharge summaries coming from different hospitals and from different care units. The output of the system consists in stating for each document, if there is a case of healthcare-associated infection. The linguistic processor which analyzes hospital discharge summaries is a general purpose tool which has been adapted for the medical domain. It extracts textual elements that may lead to an infection suspicion. Jointly with the extraction of suspicious terms, the system performs a negation and temporal processing of texts in order to refine the extraction. We first describe the system that has been developed and give then the results of a preliminary evaluation.
Mots clés : Extraction d'information médicale, compte-rendus d'hospitalisation, infection nosocomiale, analyse syntaxique
Keywords : Information extraction in medical domain, hospital discharge summaries, hospital acquired infections, parsing